Here is a list of all struct and union fields with links to the structures/unions they belong to:

- a -

• aligned_seq1 : AlignmentResult
• aligned_seq2 : AlignmentResult

- b -

• backward_search() : FMIndex
• build_c_table() : FMIndex
• build_occ_table() : FMIndex
• bwt : FMIndex

- c -

• C : FMIndex
• chain_score : ChainedSeed

- e -

• e_val : AffineDPScores

- f -

• f_val : AffineDPScores
• FMIndex() : FMIndex

- g -

• gapped_seq1 : LcsSegmentResult
• gapped_seq2 : LcsSegmentResult

- i -

• i : Loc

- j -

• j : Loc

- l -

• lcs_length : LcsSegmentResult
• lcs_string : LcsSegmentResult
• len : Seed
• load() : FMIndex
• locate() : FMIndex

- o -

• Occ : FMIndex
• operator<() : Seed

- p -

• ptr : AffineDPScores

- q -

• query_chain_end() : ChainedSeed
• query_chain_start() : ChainedSeed
• query_end() : Seed
• query_end_orig : AlignmentResult
• query_pos : Seed
• query_start_orig : AlignmentResult

- s -

• s_val : AffineDPScores
• sa : FMIndex
• save() : FMIndex
• score : AlignmentResult, Loc
• seeds : ChainedSeed
• sentinel_char : FMIndex

- t -

• target_chain_end() : ChainedSeed
• target_chain_start() : ChainedSeed
• target_end() : Seed
• target_end_orig : AlignmentResult
• target_pos : Seed
• target_start_orig : AlignmentResult
• text_with_sentinel : FMIndex
• time_ms : AlignmentResult