SequenceAligner
 
Loading...
Searching...
No Matches
EBLOSUM62.h
Go to the documentation of this file.
1
41double EBLOSUM62_matrix[24][24] = {
42 {4, -1, -2, -2, 0, -1, -1, 0, -2, -1, -1, -1,
43 -1, -2, -1, 1, 0, -3, -2, 0, -2, -1, 0, -4},
44 {-1, 5, 0, -2, -3, 1, 0, -2, 0, -3, -2, 2,
45 -1, -3, -2, -1, -1, -3, -2, -3, -1, 0, -1, -4},
46 {-2, 0, 6, 1, -3, 0, 0, 0, 1, -3, -3, 0,
47 -2, -3, -2, 1, 0, -4, -2, -3, 3, 0, -1, -4},
48 {-2, -2, 1, 6, -3, 0, 2, -1, -1, -3, -4, -1,
49 -3, -3, -1, 0, -1, -4, -3, -3, 4, 1, -1, -4},
50 {0, -3, -3, -3, 9, -3, -4, -3, -3, -1, -1, -3,
51 -1, -2, -3, -1, -1, -2, -2, -1, -3, -3, -2, -4},
52 {-1, 1, 0, 0, -3, 5, 2, -2, 0, -3, -2, 1,
53 0, -3, -1, 0, -1, -2, -1, -2, 0, 3, -1, -4},
54 {-1, 0, 0, 2, -4, 2, 5, -2, 0, -3, -3, 1,
55 -2, -3, -1, 0, -1, -3, -2, -2, 1, 4, -1, -4},
56 {0, -2, 0, -1, -3, -2, -2, 6, -2, -4, -4, -2,
57 -3, -3, -2, 0, -2, -2, -3, -3, -1, -2, -1, -4},
58 {-2, 0, 1, -1, -3, 0, 0, -2, 8, -3, -3, -1,
59 -2, -1, -2, -1, -2, -2, 2, -3, 0, 0, -1, -4},
60 {-1, -3, -3, -3, -1, -3, -3, -4, -3, 4, 2, -3,
61 1, 0, -3, -2, -1, -3, -1, 3, -3, -3, -1, -4},
62 {-1, -2, -3, -4, -1, -2, -3, -4, -3, 2, 4, -2,
63 2, 0, -3, -2, -1, -2, -1, 1, -4, -3, -1, -4},
64 {-1, 2, 0, -1, -3, 1, 1, -2, -1, -3, -2, 5,
65 -1, -3, -1, 0, -1, -3, -2, -2, 0, 1, -1, -4},
66 {-1, -1, -2, -3, -1, 0, -2, -3, -2, 1, 2, -1,
67 5, 0, -2, -1, -1, -1, -1, 1, -3, -1, -1, -4},
68 {-2, -3, -3, -3, -2, -3, -3, -3, -1, 0, 0, -3,
69 0, 6, -4, -2, -2, 1, 3, -1, -3, -3, -1, -4},
70 {-1, -2, -2, -1, -3, -1, -1, -2, -2, -3, -3, -1,
71 -2, -4, 7, -1, -1, -4, -3, -2, -2, -1, -2, -4},
72 {1, -1, 1, 0, -1, 0, 0, 0, -1, -2, -2, 0,
73 -1, -2, -1, 4, 1, -3, -2, -2, 0, 0, 0, -4},
74 {0, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, -1, -1,
75 -1, -2, -1, 1, 5, -2, -2, 0, -1, -1, 0, -4},
76 {-3, -3, -4, -4, -2, -2, -3, -2, -2, -3, -2, -3,
77 -1, 1, -4, -3, -2, 11, 2, -3, -4, -3, -2, -4},
78 {-2, -2, -2, -3, -2, -1, -2, -3, 2, -1, -1, -2,
79 -1, 3, -3, -2, -2, 2, 7, -1, -3, -2, -1, -4},
80 {0, -3, -3, -3, -1, -2, -2, -3, -3, 3, 1, -2,
81 1, -1, -2, -2, 0, -3, -1, 4, -3, -2, -1, -4},
82 {-2, -1, 3, 4, -3, 0, 1, -1, 0, -3, -4, 0,
83 -3, -3, -2, 0, -1, -4, -3, -3, 4, 1, -1, -4},
84 {-1, 0, 0, 1, -3, 3, 4, -2, 0, -3, -3, 1,
85 -1, -3, -1, 0, -1, -3, -2, -2, 1, 4, -1, -4},
86 {0, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1,
87 -1, -1, -2, 0, 0, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -4},
88 {-4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4,
89 -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, 1}};
double EBLOSUM62_matrix[24][24]
Definition EBLOSUM62.h:41